廠房維修翻新工程的付款方式與結算通常需要按照合同約定進行。一般來說，付款方式可以根據維修翻新工程的階段和進度進行劃分，以下是一種可能的付款方式：

預付款：在工程開始之前，業主向施工單位支付一定比例的預付款，用于購買材料和支付人工費用等前期費用。預付款的比例和金額可以根據合同約定和工程實際情況確定。

進度款：在工程的不同階段，業主根據施工單位的實際完成情況和質量驗收結果，向其支付一定比例的進度款。進度款的比例和金額可以根據合同約定和工程實際情況確定。

驗收款：在工程完工并通過驗收后，業主向施工單位支付一定比例的驗收款。驗收款的比例和金額可以根據合同約定和工程實際情況確定。

質保款：在工程完工并通過驗收后的一段時間內（通常為一年），業主向施工單位支付一定比例的質保款。質保款的比例和金額可以根據合同約定和工程實際情況確定。

在結算方面，業主和施工單位需要根據合同約定的結算方式進行結算。一般來說，結算需要考慮工程的實際完成情況、質量驗收結果、合同約定的結算方式等因素。結算結果需要雙方簽字確認，并作為工程最終結算的依據。

需要注意的是，付款方式和結算方式需要在合同中明確約定，并在實際施工過程中得到雙方認可和遵守。如果有任何爭議或問題，雙方需要及時溝通和協商，確保工程順利進行并按時結算。