如果樓頂做完防水后下雨，有以下幾種處理方法：

防水層覆蓋：如果防水層已經完全覆蓋樓頂，那么下雨不會對防水層產生影響，不需要采取額外的措施。

防水層未覆蓋：如果防水層還未完全覆蓋樓頂，那么下雨可能會對防水層產生影響，需要采取相應的措施。首先，可以在樓頂覆蓋一層薄膜，以防止雨水滲透到防水層下面。其次，如果防水層已經做好，但還未完全覆蓋樓頂，可以繼續進行防水層的施工，直到防水層完全覆蓋樓頂。

防水層損壞：如果防水層已經損壞，那么下雨會對防水層產生影響，需要進行維修。可以聯系專業的防水維修公司進行維修，維修完成后需要進行驗收，確保維修質量符合要求。

需要注意的是，在防水層未覆蓋或損壞的情況下，下雨可能會對樓頂產生影響，因此需要及時采取措施，以避免對樓頂造成更大的損害。